Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF5Q13243 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF5Q13243 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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