Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNA1Q09470 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA1Q09470 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms