Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms