Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLOD1Q02809 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms