Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2C1P98194 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2C1P98194 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms