Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms