Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO2P25791 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO2P25791 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO2P25791 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO2P25791 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO2P25791 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO2P25791 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO2P25791 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO2P25791 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO2P25791 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO2P25791 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO2P25791 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO2P25791 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO2P25791 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO2P25791 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO2P25791 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO2P25791 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMO2P25791 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO2P25791 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMO2P25791 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO2P25791 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMO2P25791 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO2P25791 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO2P25791 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO2P25791 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms