Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FCER1AP12319 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FCER1AP12319 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FCER1AP12319 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms