Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms