Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG6Q9Y2V7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms