Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.8 ms