Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHA12Q9UN75 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms