Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPCAL4Q9UM19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms