Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPG2Q9UBF2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms