Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GMIPQ9P107 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMIPQ9P107 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms