Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED17Q9NVC6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED17Q9NVC6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms