Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBN1Q9NPG3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBN1Q9NPG3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms