Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM3Q9BZL3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms