Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP25Q9BV90 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP25Q9BV90 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms