Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGD4Q96M96 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGD4Q96M96 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.6 ms