Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VPS50Q96JG6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms