Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC34Q96HJ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC34Q96HJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms