Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SIRT1Q96EB6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SIRT1Q96EB6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SIRT1Q96EB6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.4 ms