Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf3Q8WVX3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf3Q8WVX3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms