Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3W7

SCYL2, SCY1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL2Q6P3W7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SCYL2Q6P3W7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCYL2Q6P3W7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCYL2Q6P3W7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCYL2Q6P3W7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms