Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB12Q6NXP0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB12Q6NXP0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms