Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47AQ5JRC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms