Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR2Q2VWA4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR2Q2VWA4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR2Q2VWA4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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