Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIF1AQ16665 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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