Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX2Q16385 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX2Q16385 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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