Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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