Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM115Q12893 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM115Q12893 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms