Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIRE1Q08AE8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIRE1Q08AE8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms