Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REG1BP48304 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REG1BP48304 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REG1BP48304 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REG1BP48304 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REG1BP48304 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REG1BP48304 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG1BP48304 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG1BP48304 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG1BP48304 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REG1BP48304 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG1BP48304 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REG1BP48304 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REG1BP48304 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms