Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHKA1P46020 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKA1P46020 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms