Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITGAEP38570 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms