Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH5P33151 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH5P33151 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH5P33151 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH5P33151 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH5P33151 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH5P33151 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH5P33151 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH5P33151 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH5P33151 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH5P33151 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH5P33151 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH5P33151 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH5P33151 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH5P33151 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH5P33151 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH5P33151 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH5P33151 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH5P33151 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH5P33151 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH5P33151 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms