Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C6orf47O95873 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6orf47O95873 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms