Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC2O95347 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC2O95347 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC2O95347 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC2O95347 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC2O95347 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC2O95347 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC2O95347 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC2O95347 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC2O95347 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC2O95347 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC2O95347 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC2O95347 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC2O95347 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC2O95347 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC2O95347 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMC2O95347 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMC2O95347 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC2O95347 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC2O95347 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms