Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 MYO18A-218ENST00000546105 1442 ntTSL 222.53■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.11■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.893e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 520.23■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.63e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.346e-10■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 317.05■□□□□ 0.323e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 416.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TNS3-210ENST00000469470 584 ntTSL 314.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ADCY9-203ENST00000571889 585 ntTSL 514.58□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EPB41L2-225ENST00000530707 565 ntTSL 414.22□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 314.07□□□□□ -0.163e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 514.07□□□□□ -0.163e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 514.04□□□□□ -0.163e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 513.8□□□□□ -0.23e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 CCDC85C-202ENST00000554877 543 ntTSL 413.78□□□□□ -0.23e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 213.76□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 MYO18A-205ENST00000529578 2667 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-219ENST00000479955 420 ntTSL 313.23□□□□□ -0.293e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EGLN3-207ENST00000550114 566 ntTSL 413.16□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 313.13□□□□□ -0.316e-10■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 CCDC85C-205ENST00000556348 556 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.21□□□□□ -0.453e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 AC010203.1-201ENST00000548404 928 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 CCDC85C-203ENST00000554996 619 ntTSL 411.67□□□□□ -0.543e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 MYO18A-201ENST00000527312 573 ntTSL 211.56□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 211.28□□□□□ -0.63e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 ADCY9-206ENST00000575550 569 ntTSL 411.17□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-210ENST00000612285 1852 ntTSL 511.12□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 MYO18A-211ENST00000531438 565 ntTSL 411.12□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 310.82□□□□□ -0.683e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 LINC02280-201ENST00000564585 3816 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EPB41L5-204ENST00000443902 3167 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 TRAPPC12-214ENST00000462983 543 ntTSL 410.28□□□□□ -0.763e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-221ENST00000637845 2472 ntTSL 510.07□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EGLN3-203ENST00000487915 848 ntTSL 510.06□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-216ENST00000636992 1514 ntTSL 59.98□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-220ENST00000637562 1524 ntTSL 59.42□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 39.41□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-208ENST00000563011 2015 ntTSL 58.34□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 EPB41L5-207ENST00000466241 566 ntTSL 27.73□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-205ENST00000464071 1065 ntTSL 27.26□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 27.22□□□□□ -1.253e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-211ENST00000635892 1085 ntTSL 56.35□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SCN1A-216ENST00000637968 4614 ntTSL 56.27□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-201ENST00000268349 2799 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FARP2-218ENST00000485051 575 ntTSL 35.9□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FARP2-212ENST00000471447 580 ntTSL 45.9□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SCN1A-214ENST00000637038 4268 ntTSL 54.26□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 44.06□□□□□ -1.761e-7■■■■■ 34.3
DKC1O60832 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.953e-14■■■■■ 34.3
DKC1O60832 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-209ENST00000471341 5097 ntTSL 28.33□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-211ENST00000482386 889 ntTSL 1 (best)5.17□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 GON4L-206ENST00000466224 690 ntTSL 24.03□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 WDYHV1-204ENST00000519199 949 ntTSL 211.25□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 WDYHV1-207ENST00000523551 853 ntTSL 310.25□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 WDYHV1-202ENST00000517609 909 ntTSL 27.49□□□□□ -1.214e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 WDYHV1-209ENST00000524254 764 ntTSL 36.23□□□□□ -1.414e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 34.2
DKC1O60832 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 219.9■□□□□ 0.783e-21■■■■■ 34.2
DKC1O60832 LASP1-207ENST00000581485 617 ntTSL 317.8■□□□□ 0.443e-21■■■■■ 34.2
DKC1O60832 LASP1-202ENST00000419929 762 ntTSL 317.67■□□□□ 0.423e-21■■■■■ 34.2
DKC1O60832 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)17.48■□□□□ 0.393e-21■■■■■ 34.2
DKC1O60832 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 424.38■■□□□ 1.495e-8■■■■■ 34.1
DKC1O60832 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 223.72■■□□□ 1.395e-8■■■■■ 34.1
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