Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNCRIPO60506 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCRIPO60506 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCRIPO60506 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms