Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCO2O43819 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCO2O43819 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCO2O43819 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCO2O43819 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCO2O43819 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCO2O43819 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCO2O43819 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCO2O43819 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCO2O43819 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCO2O43819 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCO2O43819 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCO2O43819 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCO2O43819 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCO2O43819 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCO2O43819 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCO2O43819 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCO2O43819 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCO2O43819 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCO2O43819 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCO2O43819 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCO2O43819 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCO2O43819 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCO2O43819 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCO2O43819 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCO2O43819 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCO2O43819 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCO2O43819 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCO2O43819 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCO2O43819 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCO2O43819 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCO2O43819 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCO2O43819 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCO2O43819 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCO2O43819 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms