Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP73O15350 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP73O15350 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TP73O15350 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TP73O15350 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TP73O15350 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TP73O15350 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP73O15350 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP73O15350 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP73O15350 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TP73O15350 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TP73O15350 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP73O15350 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP73O15350 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP73O15350 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP73O15350 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP73O15350 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TP73O15350 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TP73O15350 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TP73O15350 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TP73O15350 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.2 ms