Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4BP3O15049 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4BP3O15049 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms