Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROB1E7EW31 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROB1E7EW31 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms