Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01549A6NIU2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms