Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYVE1Q9Y5Y7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms