Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LRP12Q9Y561 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LRP12Q9Y561 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms