Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HES2Q9Y543 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HES2Q9Y543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms