Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LSM7Q9UK45 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM7Q9UK45 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms